Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms