Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nckap5lQ6GQX2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms