Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Carmil1Q6EDY6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms