Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms