Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZC8

Gpalpp1, GPALPP motifs-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpalpp1Q69ZC8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpalpp1Q69ZC8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms