Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp4Q68FH0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms