Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg9aQ68FE2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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