Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sp9Q64HY3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sp9Q64HY3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Sp9Q64HY3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp9Q64HY3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms