Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou4f3Q63955 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms