Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift52Q62559 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms