Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20854Q62461 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms