Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SypQ62277 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SypQ62277 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SypQ62277 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SypQ62277 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SypQ62277 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SypQ62277 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SypQ62277 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SypQ62277 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SypQ62277 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms