Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six3Q62233 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms