Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh1a2Q62148 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms