Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Npm1Q61937 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npm1Q61937 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms