Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prg2Q61878 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms