Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms