Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli3Q61602 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms