Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms