Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms