Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod1Q60867 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod1Q60867 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms