Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms