Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ClpbQ60649 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClpbQ60649 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms