Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc125Q5U465 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms