Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brip1Q5SXJ3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms