Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms