Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms