Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Utp18Q5SSI6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp18Q5SSI6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms