Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm11487Q5RIS0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm11487Q5RIS0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms