Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc1Q5NCF2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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