Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm12253Q5NC48 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm12253Q5NC48 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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