Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam20cQ5MJS3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20cQ5MJS3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms