Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf3Q5HZG4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf3Q5HZG4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms