Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hs3st6Q5GFD5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hs3st6Q5GFD5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hs3st6Q5GFD5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hs3st6Q5GFD5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hs3st6Q5GFD5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hs3st6Q5GFD5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms