Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ecm2Q5FW85 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms