Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms