Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig2Q52KR2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms