Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spire1Q52KF3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spire1Q52KF3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms