Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhox3aQ4TU90 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox3aQ4TU90 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms