Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3lQ4KL14 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3lQ4KL14 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms