Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shank3Q4ACU6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shank3Q4ACU6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shank3Q4ACU6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shank3Q4ACU6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shank3Q4ACU6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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