Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin28bQ45KJ6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28bQ45KJ6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms