Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc110Q3V125 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc110Q3V125 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms