Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3UZV7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3UZV7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms