Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clpsl2Q3UW21 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms