Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms