Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
A530084C06RikQ3UTW2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
A530084C06RikQ3UTW2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms