Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BB287469Q3UT53 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms