Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcho2Q3UQN2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho2Q3UQN2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho2Q3UQN2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho2Q3UQN2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcho2Q3UQN2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho2Q3UQN2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho2Q3UQN2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcho2Q3UQN2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms