Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc4Q3UP24 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms